在食品、飲料、制藥等行業中，要求對一些包裝完的產品進行水浴滅菌。被包裝好的產品放在可調速的不銹鋼網帶上，在傳送帶的作用下按序進入滅菌箱體內，經由“高溫水為介質”殺菌后，再由傳送帶送入冷卻箱體內均勻冷卻，從而達到產品殺菌要求。該飲料巴氏殺菌機連續運轉，已滅菌的包裝產品被*送入下一生產工序。
一般來說，飲料殺菌的方法主要分為熱殺菌和冷殺菌兩種，其中：
1、熱殺菌：在果汁熱殺菌方法中，有巴氏殺菌（低溫長時殺菌法）、高溫短時殺菌法和超高溫瞬時殺菌法之分。熱殺菌方法的殺菌效果較好，但溫度往往在殺菌的同時給果汁的品質帶來不利的影響，如變色、變味、營養損失等。
2、冷殺菌：冷殺菌方法有物理殺菌和化學殺菌兩大類。物理殺菌是運用物理手段，如場（包括電場、磁場）、高壓、電子、光等的單一作用或者兩種以上的共同作用，在低溫或常溫下達到殺菌目的的方法。常見的物理殺菌技術有超高壓脈沖電場殺菌、脈沖強光殺菌、高壓靜電場殺菌、半導體光催化殺菌、微波殺菌和輻照殺菌等。
1）化學殺菌是利用化學試劑使菌體蛋白凝固變性，干擾酶活性，抑制細菌代謝和生長，或損害細菌膜結構，破壞其生理功能達到滅菌。常見的化學殺菌法有使用過氧化氫、環氧乙烷、次氯酸鈉等化學試劑殺菌。
2）物理殺菌技術是“綠色”殺菌技術，其與熱殺菌和化學殺菌相比有如下特點，殺菌效果較高，避免了高溫造成的營養損失，能夠更好地保持果汁的自然風味，避免了化學試劑對人體的傷害，也減少了化學試劑對環境的污染。
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